Inden den indholdsmæssige del af en miljøgodkendelse (eller en tilladelse) udformes, skal der tages stilling til, om det ansøgte svarer til det, der efter reglerne skal godkendes samlet.
Foreligger der tidligere godkendelser, skal der tages stilling til disse ved ny ansøgning.
Husdyrgodkendelsesloven finder primært anvendelse på drifts- og accessoriske bygninger til husdyrproduktion. På ejendomme, der anvendes til husdyrproduktion, kan der dog også udøves andre aktiviteter.
Der kan udarbejdes en plan for, hvad der skal ske ved husdyrbruges ophør.